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1、化学式不一样，次氯酸的化学式是HClO，次氯酸钠的化学式是NaClO；
2、外观不一样，次氯酸存在溶液中的时候，浓溶液会呈现出淡黄色的外观，而稀溶液会呈现出无色的外观；次氯酸钠的颜色则是微黄色，且还有像氯气的气味；
3、杀菌的原理不一样，次氯酸主要是通过利用分解产生的氧原子的还原性，让菌体和病毒上的蛋白质产生物质变性，以达到杀菌消毒的作用；而次氯酸钠主要是通过水解产生次氯酸，利用次氯酸的特性来达到杀菌消毒的目的的；
4、性质不一样，次氯酸本身作用分解后会变成水，浓度适宜的情况下不会产生刺激性；次氯酸钠在水解的过程中会产生氯气，刺激性会比较强；
5、适用范围不一样，次氯酸可以用于皮肤消毒、饮用水消毒、水箱消毒、物体表面消毒、医疗器械消毒、粘膜消毒、空气消毒等；次氯酸钠主要用于造纸、纺织、制药、精细化工、漂白等方面的消毒。
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